[서울=뉴스핌] 김신영 기자 = "단백질 간 상호작용(PPI) 빅데이터를 만들기 위해 15년 간 고유 플랫폼 개발에 주력해왔습니다. 해외에서 플랫폼을 들여와 운용하는 게 아닌, 저희 만의 독자적인 기술 플랫폼을 기반으로 사업 영역을 개척해나가고 있습니다."

윤태영 프로티나 대표는 15일 열린 IPO 기자간담회에서 "프로티나의 PPI 빅데이터 생성 플랫폼은 PPI 바이오마커 개발부터 항체 신약개발까지 신약개발 전주기에 활용한 가능한 게임체인저 플랫폼이 될 것"이라며 이같이 말했다.

[서울=뉴스핌] 김신영 기자 = 윤태영 프로티나 대표가 25일 열린 IPO 기자간담회에서 인사말을 하고 있다. 2025.07.15 sykim@newspim.com

지난 2015년 한국과학기술원(KAIST) 교원창업으로 설립된 프로티나는 세계 최초로 단일분자 수준의 단백질 간 상호작용을 분석할 수 있는 플랫폼 'SPID(Single-molecule Protein Interaction Detection) 플랫폼'을 상용화한 PPI 빅데이터 기업이다.

SPID 플랫폼은 비정제 시료에서도 분석이 가능한 PPI 전용 분석칩 'Pi-Chip', PPI 데이터를 신속하고 정확하게 대량 획득하는 장비 'Pi-View', 그리고 획득된 데이터를 자동 검출·분석하는 소프트웨어 'Pi-InSight'로 구성되어 있으며 극한의 민감도 수준의 단일분자 PPI 분석이 가능하다.

프로티나는 이를 기반으로 임상용 빅데이터 솔루션인 'PPI PathFinder'와 항체-항원 빅데이터 솔루션인 'PPI Landscape'을 상용화해 주요 솔루션으로 서비스하며 신약 개발 초기부터 임상 단계까지 신약 개발 전주기에 걸친 솔루션을 제공하고 있다.

PPI PathFinder는 기존에 없던 혁신 기술로, PPI 복합체를 바이오마커로 사용해 약물의 작용 기전 분석, 약력학 분석을 통한 최적 투여 용량 결정 등에 활용할 수 있다.

이를 통해 투여 약물의 반응성 예측을 위한 바이오마커 개발 뿐 아니라, 바이오마커 기반 동반진단 등에도 활용할 수 있다. 현재까지 다양한 단백질 타깃에 대한 바이오마커를 개발했으며 추가로 184개의 PPI 바이오마커 개발 가능성을 검증했다. 미국식품의약국(FDA)의 Project OPTIMUS 가이드라인에 부합하는 기술적 강점도 지니고 있다.

윤 대표는 "작은 임상샘플에서 PPI 컴플렉스를 10개 종류 이상 분석할 수 있는 건 저희 뿐"이라며 "파일럿 스터디로 시작해 임상이 진행됨에 따라 반복적으로 계약이 진행되고 나아가서는 계약 규모가 커지는 구조"라고 설명했다.

프로티나는 PPI PathFinder의 기술력을 현재 다수의 다국적 제약사 임상시험에 적용하고 있다. BCL-2 표적 항암제인 베네토클락스를 투여받은 환자의 임상 검체를 분석하고 베네토클락스의 환자 반응성을 예측할 수 있는 진단모델을 개발하는 데 성공했다.

오는 2026년에는 CLIA랩 인수를 통해 세계 최초의 베네토클락스 진단제품을 출시해 혈액암 환자의 미충족 수요에 대응할 예정이다.

프로티나는 PPI Landscape 솔루션을 활용한 파트너사와의 공동 개발 및 자체 신약 개발 파이프라인 확보에도 박차를 가하고 있다. PPI Landscape는 고유의 SPID 플랫폼을 이용해 생성한 항원-항체 간 PPI빅데이터 기반으로 항체 최적화부터 항체 설계까지 가능한 솔루션이다.

이 솔루션을 활용해 기존 항체를 최적화해 가치를 높이고, 이미 허가된 블록버스터급 항체의약품의 개량을 통해 효능과 안전성을 개선한 신약 후보물질로 재설계하는 항체 신약 개발에도 활용되고 있다.

자체 개발 파이프라인 중 공개된 후보물질인 항-TNFα 바이오베터는 전임상 실험에서 기존 의약품인 '휴미라' 대비 20~100배 적은 투여 용량에서도 동등하거나 우수한 효능을 확인해 현재 글로벌 파트너사들과 협의를 진행중에 있다.

윤 대표는 "프로티나는 PPI Landscape를 활용해 최소의 과학자와 적은 규모의 리소스를 기반으로 10배 정도 빠른 데이터를 만들고 있다"며 "전 세계에서 가장 빠르게 항체 데이터를 만들고 있다"고 자신했다. 이어 "항체의약품 개량의 경우, 기존 블록버스터 약물의 개발성을 보존하면서 단점을 개량하는 방식으로 이뤄진다"며 "더 우수한 항체 물질을 찾아내는 것이 목표"라고 말했다.

프로티나는 PPI 빅데이터 기반 바이오마커 개발을 넘어 진단 제품, 항체신약 공동개발, 자체 파이프라인 개발 등으로 수익모델을 다각화하며 경쟁력 강화에 속도를 내고 있다.

2026년부터는 공동 개발과 자체 개발 파이프라인을 통해 기술이전에 따른 선급금, 단계별 기술료 및 향후 경상기술료 수취를 목표로 할 예정이다. 세계 최고의 PPI 빅데이터 생성 역량을 기반으로 글로벌 바이오테크 기업으로 성장해 나간다는 포부다.

프로티나의 총 공모 주식수는 150만주로, 공모가 희망 밴드는 1만1000원~1만4000원이다. 총 공모 규모는 165억원~210억원이며, 예상 시가총액은 약 1190억원~1510억원 사이가 될 전망이다.

회사는 상장을 통해 유입된 자금으로 PPI 바이오마커 기반 베네토클락스 진단 제품의 출시 및 진단 서비스를 위한 미국 내 CLIA 인증 랩의 인수를 통해 PPI PathFinder의 수익 사업화를 촉진하는 한편, PPI Landscape기반 항체 신약의 공동개발 및 자체 개발 파이프라인 강화를 위한 연구개발과 기술이전 등에 활용할 계획이다.

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