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[디지털바이오 융합] ③ 암 유전단백체 데이터 국제사회 공유…데이터품질 관리 견인

기사입력 : 2023년05월25일 10:06

최종수정 : 2023년06월01일 09:51

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바이오데이터 주도권 쥔 미국·EU·일본
국제 수준 유전체 DB 저장소 인정 추진
데이터 품질선도센터의 국제협력 전개

[세종=뉴스핌] 이경태 기자 = 전세계를 악몽을 이끈 코로나바이러스19가 출현했을 때 중국이 해독한 유전체 서열은 미국 국립생물공학정보센터(NCBI)의 데이터베이스인 젠뱅크에 등록됐다. 등록 1주일만에 코로나19 유전체 서열은 전 세계에 공개됐다. 

이를 토대로 각국은 백신부터 치료제, 진단키드 개발을 할 수 있었다. 실제 치료제로 이용된 항바이러스제인 '렘데시비르'가 코로나19 환자 치료에 긴급 승인을 받아 사용될 수 있었던 것도 바이오 데이터를 공유했기 때문이다.

다만 바이오데이터 역시 데이터패권 경쟁에서 자유롭지 못한 상황이다. 현재까지는 미국을 비롯해 유럽연합(EU), 일본이 바이오 데이터의 주도권을 쥐고 있다.

이에 맞서 우리나라의 경우, 초기이긴 하나 국가생명연구자원정보센터(KOBIC)가 관리하는 국가 바이오 데이터 스테이션(K-BDS)의 위상을 높여 바이오데이터 분야에서의 국제 협력을 이끌어가야 한다는 목소리가 높아지고 있다.

글로벌 바이오데이터 주도권 갖고 있는 미국·EU·일본

생명과학 기술(BT)에 정보기술(IT)를 융합해 생명 정보를 다루는 생명정보학의 중요성이 날로 높아지는 추세다. 생명정보학을 통한 연구가 활발해지면서 데이터를 가공하고 표현하는 일 역시 중요한 요소로 손꼽힌다.

현재 국제적으로 바이오데이터에 대한 대표적인 관리 기관으로는 ▲미국의 국립 생물 정보 센터인 NCBI(National Center for Biotechnology) ▲EU의 EBI(European Bioinformatics Institute)▲일본
의 DDBJ(DNA DataBank of Japan) 등이 있다.

이들 기관은 국제 염기서열 데이터베이스 연합(INSDC)을 통해 거의 동일한 정보를 국제사회에 공유하고 있다. 데이터를 상호 공유하면서 최신의 정보를 취합하고 있는 것으로도 평가된다. 

코로나바이러스19에 대한 유전체 서열이 전세계에 공유되면서 백신, 치료제 등 개발에 속도를 높일 수 있었다. [자료=게티이미지뱅크] 2023.05.25 biggerthanseoul@newspim.com

이같은 바이오데이터는 이미 코로나19 팬데믹 상황에서 유전체 서열을 공유하면서 인류가 위기를 극복할 수 있도록 도왔다.

예를 들어 암 유전단백체에 대한 연구 데이터와 또 다른 암 연구 데이터를 토대로 암 발생을 정확하게 예측하고 분석할 수 있는 '메타분석' 연구를 할 수 있게 된다는 얘기다.

그만큼 인류가 극복하고자 하는 질병이나 또 다른 위기를 극복하기 위한 단초를 제공하고 이를 전세계 연구자들이 동일한 정보로 제공받게 된다는 애기다. 

생명공학계 한 관계자는 "코로나19를 극복한 사례가 이같은 바이오데이터에 대한 공유 효과를 가장 잘 설명한 사례가 될 것"이라며 "생명공학 차원에서 인류에 닥친 감염병 위협에 맞서 범국가적인 데이터의 신속한 공유와 협력이 난제를 해결할 수 있는 토대가 되고 있다"고 말했다.

다만 바이오데이터에 대한 관리는 미국, EU, 일본이 주도권을 갖고 있다는 점에 우려의 목소리도 높다.

◆ 국제적 수준의 유전체 데이터 저장소로서의 인정 '관건'

국제 수준의 유전체 데이터 저장소로 인정받는다는 것은 유전체학 분야에서 세계적인 규모로 탁월한 지위와 신뢰를 얻은 것을 말한다. 

국제 수준의 유전체 데이터 저장소로 인정 받기 위해서는 저장소의 기능을 비롯해 인프라 및 책임있는 데이터 관리에 대한 노력 등을 입증하는 특정 기준이나 표준을 충족해야 한다. 

우리나라는 국가생명연구자원정보센터(KOBIC)가 관리하는 국가 바이오 데이터 스테이션(K-BDS)의 위상을 높여 바이오데이터 분야에서의 국제 협력을 확대해나가고 있다. [자료=국가생명연구자원정보센터] 2023.05.25 biggerthanseoul@newspim.com

이같은 요소로는 ▲데이터 품질 및 무결성 ▲데이터 접근성 ▲데이터 보안 및 프라이버시 ▲데이터 상호 운용성 ▲거버넌스 및 지속 가능성 등이 꼽힌다.

일반적으로 연구 결과인 논문을 투고할 때 대다수의 저널은 논문 게재의 요건으로 데이터 등록을 요구한다. 이들 저널들은 유전체 데이터 저장소로서 공신력이 있는 INSDC 3개 기관을 현재 지정하고 있는 상황이다.

저널들이 지정한 기관처럼 공신력을 얻기 위한 객관적인 요소가 확인돼야 국제적 수준의 저장소로 도약할 수 있다는 얘기다. 

이에 따라 KOBIC은 K-BDS가 국제적 수준의 유전체 데이터 저장소로서 인정을 받기 위해 INSDC의 일원인 일본 DDBJ와 지속적 교류를 진행하고 있다. 이같은 교류를 바탕으로 INSDC 참여를 추진하고 있는 상황이다.

이와 함께 25일 일본 DDBJ에서 여는 INSDC 연례회의에 초청받아 K-BDS와 운영기관인 KOBIC을 소개할 기회도 얻은 상태다. 향후 INSDC에 합류하게 된다면 국내 바이오데이터 저장소에 데이터를 등록하더라도 국제사회의 유전체 연구에 적극 활용될 수 있을 것으로 기대된다. 

이렇게 되면 해외 연구자들과 국내 연구자들 간의 공동 연구가 활성화돼 국내 연구진의 바이오 연구 성과 역시 함께 시너지를 낼 수 있을 것이라는 게 KOBIC의 설명이다.

한·중·일 3국의 대표적인 생명정보 기관인 KOBIC(한국), NGDC(중국), DDBJ(일본) 등의 기관이 해마다 생명정보 최신 바이오 데이터 기술을 공유하는 등 아시아생명정보컨소시엄을 열고 있다. 이 장면은 제19회 아시아생명정보컨소시엄의 모습이다. [자료=국가생명연구자원정보센터] 2023.05.25 biggerthanseoul@newspim.com

이와 함께 2002년부터 최근까지 아시아생명정보컨소시엄(ABC, Asian Bioinformatics Consortium)을 열고 K-BDS를 소개하는 등 국제적 인식도 제고를 위한 노력도 진행하고 있다. 아시아생명정보컨소시엄은 한·중·일 3국의 대표적인 생명정보 기관인 KOBIC(한국), NGDC(중국), DDBJ(일본) 등의 기관이 해마다 생명정보 최신 바이오 데이터 기술의 교류를 위해 개최하는 심포지엄이다.

단백체·화합물·대사체·바이오이미징 데이터 품질선도센터의 국제협력 전개

유전체 이외에도 글로벌 연구가 필요한 단백체, 화합물, 대사체, 바이오이미징 등 주요 데이터 타입에 대해서는 각 품질선도센터(DCC, Data Curation Center)가 K-BDS의 국제적 인식도 제고를 위해 국제협력에 나서고 있다.

DCC는 고품질의 데이터 생산부터 해석까지 수요자 맞춤 연구 지원 및 분야별 데이터의 큐레이션, 품질관리를 수행하는 기관을 말한다. 실제 유전체 및 기타 데이터는 KOBIC이 품질관리를 수행하며, 단백체, 대사체, 화합물, 바이오이미징 데이터는 DCC를 지정해 품질관리를 수행중이다.

단백체 품질선도센터(PDCC, Proteomics DCC)는 국제 암 유전단백체 콘소시엄(ICPC)에 참여해 암 유전 단백체의 연구결과와 데이터를 공유하고 논의하고 있다. [자료=게티이미지뱅크] 2023.05.25 biggerthanseoul@newspim.com

단백체 품질선도센터(PDCC, Proteomics DCC)의 경우, 국제 암 유전단백체 콘소시엄(ICPC)에 참여해 암 유전 단백체의 연구결과와 데이터를 공유하고 논의하고 있다. 국제인간단백체조직위(HUPO)에 참여해 다양한 단백체 데이터의 표준 분석 방법 및 연구결과를 토대로 협력을 진행하고 있다.

화합물 품질선도센터(CDCC, Chemical DCC)는 미국 국립 보건원(NIH)의 치료법 프로세스를 연구하는 센터(NCATS), 영국의 유럽생물정보학연구소(EBI) 등 기관 등을 방문해 데이터 국제 표준화 및 데이터 교류 등 포괄적 협력을 논의하고 있다. 또 화합물 관련 국제학회의 참여를 통해 최신 동향 및 기술을 공유하고 화합물 데이터 표준화 방법 등을 논의중이다.

대사체 품질선도센터(MDCC, Metabolomics DCC)는 대사체학 관련 학회(The Metabolomics Society)의 데이터 표준 태스크(Task) 그룹에 참여해 대사체 데이터의 표준화 및 품질관리 기준 제안 등을 위한 양해각서(MOU)를 체결한 바 있다. 이와 함께 비표적 대사체 분석의 QA/QC에 대한 개념 정립 및 연구자 간 합의를 도출하기 위한 컨소시엄(mQACC)에 참여해 비표적 대사체 분석의 품질보증 및 품질관리에 대한 개념 정립 등을 논의중이다.

바이오이미징 품질선도센터(BDCC, Bio-imaging DCC)는 생체 내 이미지를 통해 생물학 및 의학을 이해하는 국제 과학 조직(WMIS)과 바이오이미징 데이터 및 활용 경험 등을 공유하고 K-BDS에 적용 방법에 대한 기술적 논의를 진행하고 있다. 미국의 사우던 캘리포니아 대학의 신경 영상 연구실(LONI)과 인간 두뇌 내의 연결 초점 연구 및 연구 데이터 관리 기관(CCF) 등과의 뇌-뇌혈관 영상 프로토콜 통합 노하우도 공유되는 상황이다. 이미 제정된 데이터 구성 규칙 검토 및 운연 현황 등도 함께 논의되고 있다.

과학기술정보통신부 관계자는 "국내 바이오데이터 저장소의 글로벌 신뢰도를 얻고 자체 생산되는 바이오데이터 수준을 높이면서 바이오 연구·개발(R&D)의 성과도 함께 거둘 수 있을 것"이라며 "글로벌 사회에서 인류의 공통된 문제를 해결하는 데 우리나라도 선진국가와 어깨를 나란히 견주며 향후 바이오 산업을 키우는 데도 힘을 보탤 수 있을 것"이라고 기대했다.

biggerthanseoul@newspim.com

(※ 본 기획보도는 한국생명공학연구원의 지원을 받아 작성되었습니다.)

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LG, 2년 만에 정규시즌 극적 우승 [서울=뉴스핌] 손지호 기자 = LG가 NC전 패배에도 극적으로 2년 만에 정규시즌 우승을 확정했다. SSG는 극적인 끝내기 승리로 한화의 우승 도전을 저지했다.  LG는 1일 서울 잠실구장에서 열린 NC와의 2025 KBO리그 정규시즌 마지막 경기에서 3-7로 패했다. LG는 전날 두산에 이어 NC에도 잡히며 시즌을 마쳤다. 하지만 한화가 SSG에 덜미를 잡히며 정규시즌 우승을 확정했다. 구단 네 번째 정규시즌 우승을 차지한 LG는 한국시리즈(KS)에 직행해 구단 네 번째 통합우승(정규시즌·KS 우승)에 도전한다. [서울=뉴스핌] 손지호 기자 = LG 트윈스 선수단. [사진=LG 트윈스] 2025.10.01 thswlgh50@newspim.com 8연승의 가파른 상승세를 탄 NC는 시즌 전적 70승 6무 67패로 5위 자리를 지켰다. 같은 날 6위 kt가 KIA를 제압해 승차가 없는 상태가 유지됐지만, NC(0.5109)가 kt(0.5107)를 승률 3모 차로 앞섰다. NC는 3일 열리는 SSG와의 시즌 최종전에서 승리하면 kt의 경기 결과와 관계없이 5위로 포스트시즌 막차를 탄다. 다만 이 경기에서 패하고 같은 날 kt가 한화를 잡으면 6위로 탈락한다. NC는 1회말 2사 2루에서 김현수에게 적시타를 맞아 먼저 실점했다. 하지만 3회 1사 후 김주원이 안타를 친 뒤 2, 3루를 연속으로 훔쳤고, 이후 최원준의 적시타가 나와 동점이 됐다. 기세가 오른 NC는 4회초 경기를 뒤집었다. 만루 찬스에서 김형준이 중전 적시타를 때려 2명의 주자를 불러들였다. NC는 5회초 바뀐 투수 손주영을 상대로 한 점을 더 보탰다. [서울=뉴스핌] 손지호 기자 = NC 다이노스 김형준. [사진=NC 다이노스] 2025.10.01 thswlgh50@newspim.com 8회초엔 승부에 쐐기를 박았다. 1사 만루에서 맷 데이비슨의 희생플라이가 나왔고, 이후 권희동의 2타점 적시타가 나와 7-1까지 격차를 벌렸다. NC는 8회 등판한 배재환이 2실점 했지만, 임지민, 김진호를 투입해 추가 점수를 내주지 않고 승리를 확정했다. SSG는 인천 SSG랜더스필드에서 열린 한화와의 경기에서 9회 2사에 나온 이율예의 끝내기 투런포에 힘입어 6-5 승리를 거뒀다. 한화는 이날 패배로 유일했던 우승 가능성이 사라졌다. 선발투수 코디 폰세는 6이닝 6안타(1홈런) 1볼넷 10탈삼진 2실점 호투를 펼쳤지만 불펜진이 승리를 날렸다. [서울=뉴스핌] 손지호 기자 = SSG 박성한(오른쪽)이 1일 1회말 선두 타자 홈런을 날리고 베이스를 돌고 있다. [사진=SSG 랜더스] 2025.10.01 thswlgh50@newspim.com SSG는 1회말 선두타자 박성한이 선제 솔로홈런으로 기선을 제압했다. 한화는 3회초 문현빈이 1타점 적시타를 날리며 승부를 원점으로 되돌렸다. 6회 SSG는 1사 1, 3루에서 한유섬이 삼진을 당했지만 고명준이 1타점 적시타를 날리며 다시 팀에 리드를 안겼다. 한화는 7회초 반격에 나섰다. 1사에서 대타 최인호가 2루타를 날렸고 대타 이도윤은 1타점 적시타를 날리며 2-2 동점을 만들었다. 대타 이진영은 역전 투런홈런을 터뜨리며 경기를 뒤집었다. 이어 노시환이 1타점 내야안타로 한 점을 더 추가했다. 하지만 SSG는 쉽게 물러서지 않았다. 9회말 2사에서 대타 류효승이 안타로 출루했고 뒤이어 현원회가 추격의 투런홈런을 터뜨렸다. 뒤이어 정준재의 볼넷과 이율예의 끝내기 홈런으로 경기를 끝냈다. [서울=뉴스핌] 손지호 기자 = kt 위즈 황재균. [사진=kt 위즈] 2025.10.01 thswlgh50@newspim.com   kt는 광주 기아챔피언스필드에서 열린 KIA와 원정 경기에서 9-3으로 이겼다. 71승 4무 68패가 된 kt는 이로써 3일 한화 이글스와 정규시즌 마지막 경기 결과에 따라 와일드카드 결정전 진출 여부가 정해진다. kt는 허경민이 4타수 2안타 2타점, 황재균이 5타수 2안타 2타점으로 팀 승리를 이끌었다. 안현민은 5타수 3안타 1타점으로 거들었다. kt 선발 소형준은 1회 3점을 헌납했으나 2회부터 6회까지 실점하지 않으면서 시즌 10승을 달성했다. 2022년 시즌 13승 이후 3년 만에 두 자릿수 승수를 쌓았다. kt는 선발 소형준이 1회말 난조를 보이며 3점을 내줬으나 3회초 대거 5점을 뽑아내면서 단숨에 경기를 뒤집었다. 3회 1사 후 김상수의 볼넷과 장준원의 안타로 1, 3루 기회를 잡았고 허경민, 안현민, 강백호가 차례로 1타점 안타를 날려 3-3 동점을 만들었다. kt는 경기 후반 추가점을 뽑아내면서 승부에 쐐기를 박았다. 7회초 1사 1루에서 허경민이 2루타를 때려낸 후 김민혁의 땅볼 때 3루 주자 유준규가 홈을 밟았다. 이후 KIA 좌완 불펜 최지민의 폭투가 나온 사이 3루 주자 허경민이 홈을 통과하면서 kt가 7-3으로 달아났다. 8회에도 2사 만루 찬스를 잡았고, 타석에 선 장진혁과 허경민이 연이어 밀어내기 볼넷을 골라내면서 2점을 더해 승부에 쐐기를 박았다. thswlgh50@newspim.com 2025-10-01 23:29
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긍정 영향 종목

  • Lockheed Martin Corp. Industrials
    우크라이나 안보 지원 강화 기대감으로 방산 수요 증가 직접적. 미·러 긴장 완화 불확실성 속에서도 방위산업 매출 안정성 강화 예상됨.

부정 영향 종목

  • Caterpillar Inc. Industrials
    우크라이나 전쟁 장기화 시 건설 및 중장비 수요 불확실성 직접적. 글로벌 인프라 투자 지연으로 매출 성장 둔화 가능성 있음.
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